上图显示了多种中性化合物的馏出物的保留行为取决于固定相烷基链的长度，短烷基链，如C4固定相，由于其相对于具有更长烷基链的C8和C18来说，其疏水性减小。
下图显示了在不同烷基链长度的固定相对苯并[9,10]菲(一种限制性转动的平面分子)的分离行为。苯并[9,10]菲在C4柱上相对于C8和C18而言，比预期的以疏水性为基础的固定相相比具有更短的保留时间。 注意对苯并[9,10]菲的出峰顺序不同在这几种固定相与盐酸丙咪嗪和戊苯有关。
左图显示了在苯基柱和ODS柱上分析维生素的不同保留行为，维生素B12和维生素B2在苯基柱和ODS柱上的馏出顺序正好相反。可以理解为维生素B12与苯基柱上的π-π 电子相互作用而产生的。
