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临床分离非可分型流感嗜血杆菌(NTHI)的基因组测序:这是一种高毒性菌株,从患有中耳炎的儿童体内分离得到,感染区域在耳膜和中耳之间。实验希望确定该基因组的可塑性和确认生物膜形成,致病性及慢性感染等性状相关的基因。所用文库是从Invitrogen购买的克隆于PCR4
blunt TOPO的文库,平均GC含量为38%。测序反应总体积600nl,模板60ng,引物1.25pmole,T7正向引物或M13反向引物,Big
Dye 190nl。热循环反应条件:96℃/20秒;然后96℃/0秒;50℃/0秒;60℃/45秒;共35个循环。然后用SPRI的方法进行样品纯化,在ABI
3730上进行测序反应。
(以上数据承蒙Allegheny
General Hospital基因组科学中心Dr.Garth Ehrlich,Dr.Fen Hu,Dr.Kai Shen允许引用)
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